IDENTIFICACIÓN MOLECULAR Y CARACTERIZACIÓN DE ESPECIES DE BACTERIAS ASOCIADAS A TUMORES EN FRUTALES EN CHILE

Abstract

La presencia de tumores a nivel del cuello de la corona es un problema creciente en varias especies frutales de interés agronómico, tanto en viveros como en huertos comerciales. Se desconoce si otras especies además de Agrobacterium tumefaciens estarían causando el problema en Chile y no existe un método eficaz para detectarlas. El objetivo de este trabajo fue identificar y caracterizar aislamientos obtenidos de tumores en frutales. Se aislaron 14 cepas en un medio selectivo para la familia Rhizobiaceae y se caracterizaron usando la prueba de 3-cetolactosa y la capacidad de crecer en una concentración NaCl al 2%. Se identificaron molecularmente secuenciando el gen 16S y se realizó un análisis filogenético; también se usó una PCR múltiple para diferenciar cuatro biovares y se realizó una prueba de patogenicidad inoculando plantas de arándano con los aislados. Se identificaron molecularmente 8 especies distintas pertenecientes a los géneros: Agrobacterium, Pararhizobium, Mesorhizobium y Rhizobium. Dos aislamientos identificados como Agrobacterium arsenijevicii fueron positivos en el test de 3-cetolactosa. Los aislamientos de las especies: Rhizobium larrymoorei, Rhizobium rhizogenes y Mesorhizobium erdmanii, fueron capaces de crecer en un medio con 2% de NaCl. Todos los aislamientos pertenecientes a los géneros Rhizobium, Agrobacterium y Pararhizobium amplificaron en la PCR múltiple, sin embargo los tamaños de bandas no correspondieron a los biovares descritos para esta técnica. Cuatros aislamientos identificados como: Rhizobium rhizogenes, Pararhizobium polonicum, Agrobacterium arsenijevici y Rhizobium lusitanu fueron 3 capaces de inducir la formación de tumores en plantas de arándano. Existen varias especies de la familia Rhizobiaceae asociada a tumores en frutales en Chile.